نوع مقاله : مدیریت آفات و بیماری‌های گیاهی

نویسندگان

• خشنود نوراللهی ¹
• علی علیخانی ²

¹ استادیار گروه گیاهپزشکی دانشگاه ایلام

² دانشجوی سابق بیماری شناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی دانشگاه ایلام

چکیده

اسکالد یا کچلی جو یکی از بیماری‌های متداول جو در اکثر مناطق دنیا می‌باشد. برای تعیین تنوع ژنتیکی در جدایه‌های Rhynchosporium secalis از گیاهان آلوده جو در مزارع مختلف استان شامل ایلام، آسمان آباد، سرابله، شباب، ایوان و سیروانکه لکه‌های قهوه‌ای مایل به زرد با حاشیه قهوه‌ای در قسمت‌های هوایی برگ و ساقه داشتند، نمونه برداری شد. 47 جدایه با استفاده از محیط کشت سیب زمینی دکستروز آگار برای اهداف این مطالعه به دست آمد. برای مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه‌ها، از نشانگرهای ریزماهواره استفاده شد. تعداد 42 آلل در بین همه جدایه‌ها در اثر پنج جفت آغازگر ریزماهواره مشخص شد. تعداد آلل‌ها برای هر نشانگر بین 7 تا 12 عدد بود،  شاخص نشانگر در آغازگرهای مورد مطالعه از 1/8 تا 6/7 متغیر بود. میزان تشابه ژنتیکی جدایه‌ها بر اساس ضریب دایس از صفر تا 1 متغیر بود. با رسم دندروگرام جدایه‌ها در فاصله 0/54 شانزده گروه تشخیص داده شد. در فنوگرام حاصل از گروه‌بندی جدایه‌ها بر اساس روش الحاق مجاور 17 گروه تشخیص داده شد. دانش تنوع ژنتیکی در
R. secalis سطوح مختلفی از اطلاعات را برای مدیریت منابع ژرپلاسم فراهم می‌کند. نتایج به دست آمده  از این مطالعه در اصلاح ارقام مقاوم و گسترش اقدامات قرنطینه‌ای مفید است.

کلیدواژه‌ها

• جو
• تنوع ژنتیکی
• Rhynchosporium secalis
• ریزماهواره

عنوان مقاله [English]

Genetic diversity of Rhynchosporium secalis isolates causal agent of barley scald in Ilam province

نویسندگان [English]

• KH. NOUROLLAHI ¹
• A. ALIKHANI ²

چکیده [English]

One of the most important diseases of barley is scald in the world. In order to determine genetic diversity of Rhynchosporium secalis isolates, barley plants with yellowish brown spots with brown margin, especially on leaves and stems were collected from different regions of Ilam province including: Ilam, Asemanabad, Srableh, Shabab, Ivan and Sirvan. 47 isolates obtained from infected samples using potato dextrose agar for the purposes of this study. To study the genetic diversity of the isolates, microsatellite markers were used. A set of five microsatellite primer pairs revealed a total of 42 alleles in R. secalis isolates in all isolates. The number of alleles varied from 7 to 12 for each marker. The number of marker index (MI) in all primers varied from 1.8 to 6.7 and genetic similarity based on  Dice coefficient was zero to one. Phonogram revealed 16 distinct groups in 0.54 similarity distance, but based on neighbor joining 17 groups were determined. Knowledge of genetic diversity in R. secalis provides different levels of information which is important in the management of germplasm resources. Results from this study will be useful in breeding for barley resistant cultivars and developing necessary quarantine regulations.

کلیدواژه‌ها [English]

• Barley
• Genetic diversity
• Rhynchosporium secalis
• SSR